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蛋白樣品制備詳解—雜質(zhì)去除篇

更新時(shí)間:2021-09-10

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蛋白樣品制備中,在細(xì)胞破碎之后,既可以利用特定蛋白質(zhì)的特性來分離某一類蛋白質(zhì),比如親和純化,比如前面介紹的磷酸化蛋白富集,或者膜蛋白富集;另外一個(gè)考慮方向是去除雜質(zhì)----去掉樣品中某些非目標(biāo)高豐度蛋白或者雜質(zhì)的干擾,同樣可以達(dá)到簡化樣本的目的。當(dāng)然要小心“倒洗腳水的時(shí)候別把嬰兒也倒掉了",一定要選擇可靠的產(chǎn)品。

比如,潛在疾病標(biāo)志物的最好樣本來源就是血清或其他體液,此類樣本可以提供人蛋白質(zhì)組中絕大部分組份。然而用蛋白質(zhì)組分析方法鑒定疾病標(biāo)志物最大的挑戰(zhàn)來自于血清中大量的高豐度蛋白對檢測的干擾,血清中有大約55%的蛋白為白蛋白,而IgG大約占血清中蛋白總量的10-25%,這些高豐度蛋白的存在會(huì)增加低豐度蛋白檢測的難度,去除占血清總蛋白近75%的白蛋白和IgG將有助于更好地鑒定其他的蛋白。G-Biosciences的AlbuminOUT™白蛋白去除試劑盒堪稱白蛋白去除神器。血漿和腦脊髓液等樣本中,包含大量的白蛋白,從而封閉掉在二維凝膠電泳中發(fā)現(xiàn)和鑒定其他低豐度蛋白的可能。AlbuminOUT™白蛋白去除試劑盒被設(shè)計(jì)用來在這種樣本中大量去除白蛋白。

這種白蛋白去除方法是基于白蛋白和Cibachron藍(lán)色染料的結(jié)合。AlbuminOUT™被優(yōu)化從樣本中去除人的白蛋白。AlbuminOUT™使用快速離心柱方法,每個(gè)柱子含有0.2ml的染料結(jié)合樹脂,從而可以結(jié)合大于2mg的人白蛋白。AlbuminOUT™可以從5-50微升人血漿中去除大于98%的白蛋白。

離心柱形式可以在10分鐘內(nèi)去除白蛋白。高結(jié)合力的藍(lán)色染料結(jié)合樹脂可以從人,豬,羊,狗,兔,大鼠和牛樣本中達(dá)到瞬間的結(jié)合和去除白蛋白。AlbuminOUT™或許也可以從其他物種中去除白蛋白。適用于處理25或50個(gè)樣本

圖片1.png


Figure 1:  2D  analysis  of  whole  human  serum  before  (left)  and  after (right) treatment with AlbminOUT.

產(chǎn)品特點(diǎn):

l 從樣本中不到10分鐘的時(shí)間內(nèi)去除白蛋白

l 基于白蛋白和Cibachron藍(lán)色染料的結(jié)合

l 每個(gè)柱子的結(jié)合力大于2mg的人白蛋白

l 5-50微升人血漿中去除大于98%的白蛋白

去垢劑如SDS、Tween、Tritonde等是蛋白樣品處理過程中常用的組分。去污劑在蛋白提取和樣本制備過程中是很重要的物質(zhì),特別是研究疏水蛋白時(shí)。蛋白樣本中高濃度去污劑的存在能夠影響ELISA,IEF和蛋白的蛋白酶消化,以及用質(zhì)譜進(jìn)行分析時(shí)抑制肽的離子化。

所謂請神容易送神難。要除掉這些去垢劑?G-Biosciences推出的DetergentOUT™ GB-S10去污劑去除柱子和樹脂專門設(shè)計(jì)用來除于蛋白或其他生物樣本中所含有的去污劑,樹脂能夠從蛋白水溶液和肽樣本中去除自由的,未結(jié)合的陰離子的,非離子或兩性離子的去污劑(e.g. SDS, Triton® X-100 CHAPS),同時(shí)對于下游進(jìn)行的質(zhì)譜或其他技術(shù)的分析應(yīng)用帶來最小的樣本丟失。

DetergentOUT™ GB-S10柱子在第三方的研究使用中表明*兼容DI-QTOF LC-MS/MS(請見參考文獻(xiàn))。DetergentOUT™ GB-S10柱子的使用顯著增加到了檢測到的肽光譜的數(shù)量。除此之外,DetergentOUT™ GB-S10柱子對于去污劑有高度的結(jié)合容量,比如每毫升固定的樹脂可以結(jié)合6mg SDS和14mg Triton® X-100。

常見去污劑的選擇:

圖片2.png

Table 1:  A comparison of the detergent removal rates and percentage protein recovery with DetergentOUTGBS10.

華雅思創(chuàng)生物—G-Biosciences全國授權(quán)代理

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